Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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