Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R42Q7Z4L9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms