Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF23Q7RTU1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms