Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX7Q7RTT5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms