Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDPD3Q7L5L3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms