Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGD6Q6ZV73 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGD6Q6ZV73 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms