Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BEND4Q6ZU67 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms