Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPGS1Q6ZTW0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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