Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00299Q6ZSB3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms