Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
LRRC9Q6ZRR7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC9Q6ZRR7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms