Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCBE1Q6UXH8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms