Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE12Q6L8Q7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PDE12Q6L8Q7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms