Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LCN10Q6JVE6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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LCN10Q6JVE6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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LCN10Q6JVE6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LCN10Q6JVE6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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