Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM29Q5VYK3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms