Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OTUD1Q5VV17 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
OTUD1Q5VV17 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms