Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC18Q5T9S5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC18Q5T9S5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC18Q5T9S5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms