Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD3Q5JV73 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD3Q5JV73 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms