Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf116Q5BN46 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms