Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDCA8Q53HL2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDCA8Q53HL2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms