Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP13-3Q3SY46 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms