Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TTLL9Q3SXZ7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TTLL9Q3SXZ7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms