Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF1Q3BBV0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF1Q3BBV0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms