Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms