Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC96Q2M329 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC96Q2M329 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms