Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSPP1Q1MSJ5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSPP1Q1MSJ5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms