Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDO1Q16878 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDO1Q16878 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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