Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME3Q16798 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME3Q16798 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME3Q16798 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME3Q16798 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME3Q16798 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME3Q16798 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME3Q16798 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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