Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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