Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP7Q16576 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBBP7Q16576 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms