Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NTRK3Q16288 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NTRK3Q16288 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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