Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN9AQ15858 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN9AQ15858 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
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