Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPTX1Q15818 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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