Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPEGQ15772 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPEGQ15772 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms