Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALX1Q15699 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms