Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNHIT3Q15649 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms