Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SF1Q15637 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SF1Q15637 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SF1Q15637 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SF1Q15637 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SF1Q15637 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SF1Q15637 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SF1Q15637 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms