Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TAF11Q15544 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF11Q15544 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms