Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHPRHQ149N8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHPRHQ149N8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
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