Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE4AQ14139 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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