Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CNGB1Q14028 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGB1Q14028 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms