Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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