Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNTB1Q13884 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNTB1Q13884 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms