Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDX39BQ13838 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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