Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TUBA3CQ13748 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBA3CQ13748 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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