Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX6Q13608 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX6Q13608 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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