Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TOP3AQ13472 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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