Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NR1H3Q13133 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms