Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1AQ13111 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1AQ13111 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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