Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ECH1Q13011 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ECH1Q13011 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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