Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXI1Q12951 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXI1Q12951 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXI1Q12951 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXI1Q12951 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXI1Q12951 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms